Su última etapa NBA

En mitad de la temporada 1.999/2.000 recala en los Philadelphia Sixers, saliendo desde el banquillo aportando 12.4p, 4.5r, 4.4a., dando mucha solidez y experiencia al equipo. Se clasificaron a los playoffs y caerían ante los Indiana Pacers por 4-2 en la segunda ronda. En el verano del 2.000 Toni Kukoc renueva su contrato por cuatro temporadas a razón de 7.760.000 dolares al año.

En la temporada 2.000/2.001 comienza la temporada con los Philadelphia Sixers, su aportación baja en minutos y estadísticas. Sale desde el banquillo y aporta 8.0p, 3.4r, 1.9a. Además sufre una lesión que le hace perderse algún partido, a pesar de ello los Philadelphia están lanzados con un Iverson MVP y que ese año llegarían hasta la final de la NBA. A dos meses de terminar la regular Kukoc vuelve a estar inmerso en un trade entre los Philadelphia que necesitaban un pivot para intentar parar a O`Neal y los Atlanta Hawks. En los Atlanta Hawks a Kukoc le dieron los galones de jugador franquicia, titular indiscutible y gran aportación del croata con un promedio 19.7p, 6.2a, 5.7r. Los Atlanta Hawks no se clasifican para los playoffs por lo que Kukoc se los perdería después de siete años consecutivos jugándolos.

En la temporada 2.001/2.002 un Kukoc con algunos problemas físicos juega menos minutos y saliendo desde el banquillo aporta un promedio de 9.9p, 3.7r, 3.6a. Atlanta Hawks mejora sus números comparados al año anterior, pero continua sin clasificarse a los playoffs. Kukoc ya es un veterano jugador de casi 34 años, en el que su gran experiencia en el juego le hace una pieza importante en el equipo.

En el verano del 2.002, su equipo los Atlanta Hawks hace un trade con los Milwaukee Bucks en el que incluía el intercambio de Toni Kukoc rumbo a los Milwaukee Bucks y a Glenn Robinson camino de Atlanta. En la temporada 2.002/2.003 ya en el equipo de la ribera del lago Michigan, Kukoc tiene una buena temporada, saliendo desde el banquillo y aportando un promedio de 11.6p, 4.2r, 3.7a. Es un reserva de minutos y pieza importante en su equipo. Con los Milwaukee Bucks vuelve a disputar los playoffs. De una manera efímera porque perderían en primera ronda ante los New Jersey Nets por 4-2. Unos Nets que luego serian finalistas de la NBA.

En la temporada 2.003/2.004, un Toni Kukoc cada vez mas veterano ve como sus minutos y estadísticas descienden. Este año promedia 8.4p, 3.7r, 2.7a. Los Milwaukee se calificarían para los playoffs y volverían a caer en primera ronda, esta vez ante los Pistons de Detroit por 4-1. Unos Pistons que luego se proclamarían campeones de la NBA. En verano del 2.004 Kukoc con 36 años de edad, termina contrato y los Milwaukee Bucks le renuevan por un año con un sueldo de 3.000.000 de dolares.

En la temporada 2.004/2.005, Toni Kukoc promedia 5.6p, 3.0r, 3.0a. por encuentro. El croata es utilizado para jugar sus minutos de calidad y aportar su enorme talento al servicio del equipo dentro de sus posibilidades físicas. Los Milwaukee Bucks no lograrían clasificarse para los playoffs. En el verano del 2.005 termina su contrato anual. Recibe varias ofertas, incluida una de su buen amigo Maljkovic para jugar en el Real Madrid, pero él solo quiere jugar en la zona geográfica del lago Michigan por temas familiares. Finalmente renueva con los Milwaukee Bucks por otro año y 2.000.000 de dolares.

En la temporada 2.005/2.006, la ultima de su carrera deportiva, Toni Kukoc aportó 4.9p, 2.3r, 2.1a., en 16 minutos de media por partido, un Kukoc camino de los 38 años apura su carrera NBA, para muchos en demasia en los últimos años para una leyenda como el. Sus Milwaukee Bucks se clasificarían para los playoffs, perdiendo en 1º ronda ante los Detroit Pistons por 4-1. El 3 de mayo de 2.006 en el quinto partido del cruce, Kukoc saliendo desde el banquillo jugó sus últimos 19 minutos como jugador profesional, aportó 7 puntos, 2 asistencias y 1 rebote en un partido con clara victoria para los Pistons por 93-122 que sentenciaría la clasificación.

Kukoc tenia alguna oferta NBA, pero el deseo del jugador era no desplazarse de la zona del lago Michigan por asuntos familiares. Los Milwaukee ya no contaban con él para renovarlo y él deseaba jugar en los Chicago Bulls, pero los de Illinois tampoco tenían intención de ficharlo. Así que en el verano del 2.006, con 37 años de edad, se retira uno de los mayores talentos de este deporte, uno de los mejores de siempre, se retira TONI KUKOC, mi ídolo.